נושאת דגל פנמה, קופה איירליינס (CM) מבוססת פנמה סיטי. חברת התעופה, שהיא חלק מ"ברית הכוכבים", מציעה טיסות ללא הפסקה לבערך 70 יעדים ב-30 ארצות במרכז אמריקה, צפון אמריקה, דרום אמריקה ובקריביים. צי המטוסים מורכב משני תאים: מחלקת עסקים ומחלקת תיירים. המרכז של חברת התעופה ממוקם נמל התעופה הבינלאומי טוקומן (PTY) של העיר פנמה סיטי. ערי מיקוד כוללות נמל התעופה הבינלאומי אל דוראדו (BOG) של העיר בוגוטה, נמל התעופה הבינלאומי לה אורורה (GUA) של העיר גוואטמלה סיטי, נמל התעופה הבינלאומי חואן סנטמריה (SJO) שבסאן חוזה ונמל התעופה הבינלאומי אוגוסטו סי סנדינו (MGA) שבמננגואה.