‪בדומה לאינקוויזיציה הספרדית, עסקה זו הפורטוגזית ברדיפת מומרים שלא נענו לכל דרישותיה של הנצרות הקתולית.בין השנים 1821-1536 האינקוויזיציה הפורטוגלית פעלה בשלושה מוקדים מרכזיים: ליסבון, אבורה וקוימברה. ידוע כי האינקוויזיציה לא רדפה יהודים בלבד, אך בית המשפט שפעל בקוימברה שפט 267 קורבנות יהודיים אשר נכלאו בכלא שאת שרידיו ביקרנו לאחר הצצה בבית המעורר אימה וזגרונות מזמנים אפלים,,התקדמנו מעט לעבר הכנסייה,לרחבה שבה היו מוציאים להורג את הקורבנות. שנקשרו לסלע המלא כיום בטחב ,מקום ההעלאה על המוקד,ה"אוטו דה פה".‬